Sanger测序:基因解码的黄金标准_Sanger测序的方法与原理揭秘
Sanger测序:基因解码的黄金标准
Sanger测序的方法与原理揭秘
1、Sanger测序是什么?简单说,就是第一代DNA测序技术,1977年由弗雷德里克·桑格发明。直到今天,Sanger测序仍是基因检测的“金标准”,尤其在精准度要求高的场景。
2、Sanger测序的核心原理:通过链终止反应生成不同长度的DNA片段。利用ddNTP(双脱氧核苷酸)随机终止复制,再通过电泳分离片段,最后读取碱基序列。
3、为什么选Sanger测序?因为准确率高达99.99%。比如临床诊断单基因病、法医亲子鉴定,必须依赖Sanger测序的精准结果。
Sanger测序的四大应用场景
1、疾病诊断:Sanger测序用于检测BRCA1/2乳腺癌基因、囊性纤维化突变等。医院检验科常用它做最终确诊依据。
2、科研验证:新一代测序(NGS)发现可疑突变后,必须用Sanger测序二次验证。这是发SCI论文的硬性要求。
3、法医鉴定:Sanger测序分析STR位点,比快检试纸更可靠。公安部物证中心的标准流程中,Sanger测序不可替代。
4、微生物检测:食品中致病菌的溯源分析,比如沙门氏菌分型,Sanger测序仍是ISO认证方法。
Sanger测序实操指南
1、样本要求:DNA浓度需≥10 ng/μL,纯度A260/A280在1.8-2.0之间。如果做PCR产物测序,建议纯化后再送样。
2、引物设计:Sanger测序需要特异性引物,退火温度建议58-62℃。避免引物二聚体或发夹结构,可用Primer-BLAST在线验证。
3、结果解读:用Chromas软件看峰图。杂合突变会显示套峰,此时建议反向测序复核。Sanger测序的原始数据必须保存至少5年。
Sanger测序VS新一代测序
1、读长优势:Sanger测序单次可读800-1000bp,远超NGS的150-300bp。需要长片段拼接时,Sanger测序效率更高。
2、成本对比:单个样本测序,Sanger测序价格约50-100元,NGS通量高但开机成本超万元。小样本量优选Sanger测序。
3、错误率差异:NGS的原始错误率约0.1%-1%,而Sanger测序错误率低于0.001%。涉及治疗方案的关键突变,必须用Sanger测序复核。
Sanger测序常见问题解答
1、能做全基因组测序吗?不能。Sanger测序适合靶向测序,全基因组需用NGS。但特定基因的深度覆盖,Sanger测序更经济。
2、需要多久出结果?常规样本24小时内完成,加急服务可缩短至6小时。比NGS的3-7天周期快得多。
3、能否检测CNV?不能。Sanger测序主要检测点突变和小片段插入缺失,拷贝数变异需结合qPCR或MLPA。
4、为什么叫第一代?因为Sanger测序是首个自动化测序技术,后续的焦磷酸测序、边合成边测序等被归为二、三代。
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